Stage M1 ou M2 Métabolisme de petits cours d’eau intermittents en contexte tempéré océanique

Le stage s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche de 2 ans (2024-2025) financé par la Région Bretagne et le CNRS (initiative EC2CO) et qui vise à caractériser la dynamique spatiotemporelle du fonctionnement biogéochimique et métabolique de cours d’eau intermittents dans des bassins versants de méso-échelle (20-50km²) en contexte tempéré océanique. La zone d’étude comporte trois bassins versants de la ria d’Etel (Morbihan), où les suivis ont commencé début 2024. Le stage aura pour objectif d’estimer les composantes du métabolisme (production primaire, respiration) de ces cours d’eau intermittents. Pour cela deux approches seront explorées : une approche de modélisation appliquée à des séries de mesure en continu de l’oxygène dissous et des mesures de la qualité de la matière organique dissoute et de son évolution au cours de l’étiage.

Missions attendues

• Vous appliquerez un modèle du métabolisme aquatique aux séries de données d’O2 dissous et de débit (jeu de données acquis : 2 ans) pour quantifier la production primaire et la respiration des cours d’eau
• Vous participerez aux campagnes terrain de caractérisation du fonctionnement biogéochimique et métabolique : prélèvements d’échantillons d’eau (2 campagnes au cours du stage sur 3 bassins de la Ria d’Etel)
• Vous contribuerez aux analyses de laboratoire : vous réaliserez les mesures de fluorescence 3D pour caractériser la qualité de la matière organique dissoute. Le laboratoire d’analyses chimiques de l’UMR SAS dispose d’un spectrofluorimètre 3D, vous serez formé(e) en interne à l’utilisation de celui-ci pour conduire les mesures sur les échantillons issus des campagnes ci-dessus.

Compétences recherchées :

Master 1 ou Master 2, formation en sciences de l’eau ou sciences de l’environnement

Logiciel R (le modèle envisagé pour le métabolisme aquatique est le Package streamMetabolizer, Appling et al., 2018)

Les livrables du stage impliquent une capacité rédactionnelle pour la synthèse des résultats sous forme d’un rapport.

Conditions :

Encadrement : Ophélie FOVET (ophelie.fovet@inrae.fr , INRAE Rennes UMR SAS), Rémi DUPAS (remi.dupas@inrae.fr, INRAE Rennes UMR SAS) , Andres CASANOVA (andres.casanova@institut-agro.fr, Institut Agro Rennes Angers, UMR SAS) et Sophie GUILLON (sophie.guillon@minesparis.psl.eu, Ecole des Mines Paris)

Le stage sera basé sur le campus INRAE – Institut Agro Rennes Angers, 65 rue de Saint Brieuc, 35042 Rennes. Les déplacements à l’Ecole des Mines de Paris (Fontainebleau) ou sur le terrain (Belz et environ) seront prises en charges par le programme.

Durée : 6 mois pour stage M2, ou 3 mois pour stage M1; candidature avant le 15 janvier 2025.

Gratification : gratification légale d’environ 560 €/mois ; 2,5 jours de congés par mois ; accès au restaurant d’entreprise au tarif étudiant ; possibilité de prise en charge partielle de l’abonnement de transport en commun

References :

Appling, Alison P., Robert O. Hall, Charles B. Yackulic, and Maite Arroita. “Overcoming Equifinality: Leveraging Long Time Series for Stream Metabolism Estimation.” Journal of Geophysical Research: Biogeosciences 123, no. 2 (February 2018): 624–45. https://doi.org/10.1002/2017JG004140, https://github.com/USGS-R/streamMetabolizer

Messager, M.L., Lehner, B., Cockburn, C. et al. Global prevalence of non-perennial rivers and streams. Nature 594, 391–397 (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03565-5